Как и многие атлеты, выходцы из Восточной Германии, Ута не избежала подозрения в применении допинга. Длительное время проживая в США (Боулдер), в апреле 1998 по результатам проверки, Ута Пиппинг была дисквалифицирована на два года из-за аномально высокого уровня тестостерона, обнаруженного в ее анализах. После череды судебных разбирательств, адвокатам Уты удалось снять все обвинения и заключить мировое соглашение с федерацией легкой атлетики Германии (DLV).